• 期刊首页
  • 期刊简介
  • 主要内容
  • 投稿须知
  • 邮箱投稿
  • 在线投稿
  • 联系我们

栏目导航

期刊介绍
主要内容
期刊导读
投稿须知
邮箱投稿
在线投稿

通知公告

  • 关于开展2015年度民营科技企业相关工作的通知
  • 关于转发《科技部办公厅关于推荐2015年全国...
  • 2014年度山西省农村技术承包奖评审结果公示
  • 关于开展2015年度民营科技企业相关工作的通知
  • 关于山西省疾病预防控制中心晋城海斯制药有...

工作动态

  • 太原高新区与山西医科大学签署战略合作框架...
  • 厅党组书记张金旺同志进社区密切联系基层党...
  • 我厅直属事业单位2015年度公开招聘考试专业...
  • 山西召开推进电子商务企业知识产权维权工作...
  • 省科技厅部门2015年上半年预算执行正常

您现在所在位置:首页 > 期刊导读 > 2012 > 09 > 信息摘要

基因富集及Meta分析对影响肝癌发生发展关键基因的筛选

【出 处】:

【作 者】:

【摘 要】目的:筛选影响肝癌发生发展的关键基因.方法:运用跨种属肿瘤基因筛选策略比较不同种属的肝癌基因表达谱间的相似改变,选择5套不同种属的肝癌基因表达芯片分别通过基因组富集(gene set enrichment analysis,GSEA)以及对单套数据集单个基因元分析(meta-analysis,Meta)的分析方法,筛选出在转录水平上影响肝癌的基因.结果:用GSEA方法分析,5组数据中所得通路对比,上调中皆有的通路为氨基糖核苷酸糖代谢、细胞周期、甲状腺癌;下调中皆有的通路为亚油酸代谢、花生四烯酸代谢.对单套数据集单个基因进行Meta分析,共筛出P〈0.05的基因1708个.用DAVID和KEGG网站的分析工具发现这1708个差异基因中有720个基因能够在KEGG库中筛出,主要分布在细胞周期、卵母细胞减数分裂、DNA复制等通路.这两种分析方法得出的通路中,重叠性较高的主要为细胞周期通路.在细胞周期通路中差异性有统计学意义(P〈0.05)的基因25个,文献报道其中5个基因与肝癌有密切联系.结论:可能影响肝癌发生发展的信号传导通路是细胞周期通路,后续我们将对细胞周期通路里的显著性基因进行验证.

相关热词搜索: 肝癌 基因富集 Meta分析 跨种属 关键基因

上一篇:小鼠急性酒精性肝损伤模型的建立
下一篇:腺病毒介导的KDR-CDglyTK系统在治疗胃癌中的旁观者效应机制

        版权所有:《世界华人消化杂志》编辑部    晋ICP备05007566号
        地址:北京市朝阳区东四环中路62号楼远洋国际中心D座903室
    
邮编:100025