应用二代测序技术筛选压力作用下肝星状细胞的差异表达基因
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【摘 要】目的:应用基因二代测序技术检测肝星状细胞(hepatic stellate cell,HSC)在压力作用后基因表达谱改变及可能机制.方法:分离培养原代肝星状细胞,培养14 d加载10 mmHg的压力1 h,提取总RNA,逆转录cDNA,用DEG-Seq对实验组与对照组进行比较,筛选得到差异基因.结果:肝星状细胞中979条基因出现差异表达,其中14条基因表达差异最为显著,10条基因表达上调,4条基因表达下调,这些基因功能与合成代谢、免疫应答、细胞凋亡等相关.结论:应用基因二代测序技术筛选出压力作用下肝星状细胞差异表达的基因,其可能通过调控这些基因来适应外界压力刺激.
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